Em atendimento a Lei Estadual de 08 de setembro de 1892, no governo do Dr. Francisco de Paula Rodrigues Alves, que determinava o ensino obrigatório às crianças de sete a dez anos de idade, deu-se o lançamento da pedra fundamental do primeiro estabelecimento oficial de ensino de São Manuel, em 12 de agosto de 1900, num terreno adquirido por Manuel Antunes de Siqueira e por Faustina de Souza Moura. Em homenagem ao instalador da Comarca, tal estabelecimento recebeu a denominação de Grupo Escolar “Dr. Augusto Reis”.
A construção do prédio foi executada pelos irmãos Augusto, Júlio e Plínio Cannepele. A construção original era formada de dois pavimentos que comportavam dezesseis salas de aula, diretoria, salão de solenidades e almoxarifado, a frente ajardinada e nos fundos uma espaçosa área recreativa.
O prédio foi inaugurado em 10 de fevereiro de 1902, sob a direção do professor Benedito Maria Tolosa.
O edifício projetado por Victor Dubugras constitui uma solução única dentre os grupos escolares construídos na época: o ginásio foi incorporado à edificação, resultando numa fachada assimétrica. É o único projeto que apresenta esse tipo de solução, até 1920. Desde seu início até 1908, o grupo funcionou com um número de matrículas nunca inferior a 390 alunos. 
Pelo alto valor histórico na evolução educacional do Estado de São Paulo, juntamente com outras 122 escolas públicas da capital e do interior, o prédio foi tombado pelo Conselho do Patrimônio Histórico, Arqueológico, Artístico e Turístico do Estado de São Paulo (CONDEPHAAT), conforme publicação do Diário Oficial do Estado de São Paulo, do dia 7 de agosto de 2002, páginas 1 e 52. 
Em 1997, com a municipalização do ensino, a escola alterou sua denominação de Escola Estadual de Primero Grau “Dr. Augusto Reis” para Escola Municipal “Dr. Augusto Reis” e passou a integrar o quadro das escolas municipais de São Manuel, atendendo apenas aos alunos do Ensino Fundamental do 1º ao 5º ano.
Já em janeiro de 2008, atendendo a Lei Municipal nº 587, a denominação da escola é novamente alterada para Escola Municipal de Ensino Fundamental e Infantil, quando os alunos da Creche Leonor Mendes de Barros são remanejados ao seu quadro de alunos.
A partir de fevereiro de 2014, a escola novamente retoma a denominação de Escola Municipal de Ensino Fundamental “Dr. Augusto Reis, atendendo a Lei Municipal nº 3164.
Trata-se de um prédio centenário que já passou por várias reformas, mas que necessita do constante acompanhamento em decorrência das intempéries e dos desgastes pelo uso e pelo tempo.